В настоящее время Институт занимается проведением фундаментальных научных исследований по направлениям:

• астрофизика космических лучей;

• солнечно-земная физика.

Исследования ведутся по Программе фундаментальных научных исследований в Российской Федерации на долгосрочный период (2021 — 2030 годы)

I. Область научных знаний: 1. Естественные науки

Направление науки: 1.3. Физические науки

«Исследование свойств космических лучей в области энергий 10^{15} — 10^{19} эВ по данным многолетних наблюдений на Якутской комплексной установке ШАЛ» (Руководитель Иванов А.А.)

«Ускорение солнечных космических лучей в атмосфере Солнца и воздействие крупномасштабных структур солнечного ветра на пространственно-временное распределение космических лучей в гелиосфере» (Руководитель Петухов С.И.)

«Исследование магнитосферно-ионосферных возмущений по данным Якутской меридиональной цепочки станций в начале 25 цикла солнечной активности» (Руководитель Баишев Д.Г.)

«Исследование связи термодинамического состояния высокоширотной верхней и средней атмосферы с параметрами солнечной активности по данным оптических измерений и дистанционного зондирования» (Руководитель Николашкин С.В.)